分子蒸餾又稱短程蒸餾，是伴隨真空技術與真空蒸餾技術的發展而逐漸發展起來的一種液—液分離技術。經過長足發展，該技術水平日新月異，很好地消除了傳統蒸餾所具有的缺陷。目前，作為一種高真空條件下的高新液液分離技術，其在石油加工、化妝品、食品、醫藥等行業的分離和提純方面有著廣泛應用。中國化工儀器網總結了分子蒸餾設備在以下幾個領域的發展和應用。

 

　　分子蒸餾在石油化工、食品、醫藥、香精香料精細化工等領域均有運用，尤其在天然產物及熱敏性物料的分離純化方面得到廣泛的應用。例如精制魚油的提取，魚油中的EPA、DHA（這玩意兒叫腦黃金，很多嬰幼兒產品里面都有這個成分）主要從海產魚油中提取，采用分子蒸餾的魚油產品色澤好、氣味純正、過氧化值低。此外還有天然色素、天然維生素、天然揮發精油的提取，都用到分子精餾。而在石油化工領域，可以用于合成潤滑油基礎油的精制處理，還有用于油品分析，應用在減壓餾分油的深拔領域。醫藥領域用于藥物或者中間體的提純（例如抗HIV-1藥物度魯特韋的關鍵中間體4-甲氧基乙酰乙酸甲酯的提純）。